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膠原蛋白的水解產(chǎn)物含有多種氨基酸，其中以甘氨酸最為豐富。其次為丙氨酸、谷氨酸和精氨酸，半胱氨酸、色氨酸、酪氨酸以及蛋氨酸等氨基酸含量低，因此，膠原蛋白屬不完全蛋白質(zhì)。水解豬皮膠原所得的肽類產(chǎn)物中含有19種氨基酸，其中包括7種成人氨基酸和2種幼兒的半氨基酸；而且氨基酸總量高達(dá)90%以上。在八種人體氨基酸中含有六種：異亮氨酸（Ile）為1.21%，亮氨酸（Leu）和苯丙氨酸（Phe）為4.89%，纈氨酸（Val）2.95%，蘇氨酸（Thr）為1.95%，賴氨酸（Lys）為1.94%。

膠原的相對(duì)分子質(zhì)量大，電泳圖有3條泳帶，在100kD附近出現(xiàn)的2條泳帶分別是膠原分子的α1鏈和α2鏈，在200kD附近出現(xiàn)的1條泳帶是膠原分子的β鏈。即膠原的每條多肽鏈相對(duì)分子質(zhì)量可達(dá)100kD，1個(gè)膠原分子相對(duì)分子質(zhì)量為300kD。多肽分子量的測(cè)定方法常用SDS-PAGE，凝膠色譜法以及質(zhì)譜法。有人采用凝膠過濾色譜法測(cè)定脫鉻革屑中膠原水解產(chǎn)物分子量分布在16.1kD左右。飛行時(shí)間質(zhì)譜法測(cè)定比目魚皮膠原寡肽分子量的分布主要集中在0.6～1.8kD。動(dòng)物蛋白酶水解后的膠原多肽的分子量在2～7kD，比植物蛋白酶水解的膠原多肽分子量范圍更廣。